En 2016 se seguirá usando Pokémon Rubí Omega y Zafiro Alfa, además del mismo formato de batallas dobles. Sin embargo, la principal diferencia es que se permitirá tener hasta dos legendarios por equipo, los cuales anteriormente estaban completamente prohibidos.
El formato de los combates será siempre Dobles.
Se realiza 1 combate de 6 vs 6.
Antes de que empiece el combate, durante el team preview, los jugadores escogerán 4 de los 6 Pokémon registrados en su equipo para luchar.
Los Pokémon con nivel superior a 50 serán reajustados a dicho nivel (si el nivel de un Pokémon es inferior a 50, no se producirá este ajuste).
Los Pokémon que vayas a usar deberán encontrarse en la Caja de Combate del PC o en tu equipo.
Sólo se admitirán Pokémon poseedores del Pentágono Azul en la pantalla de estadísticas.
"Species Clause": no se puede repetir Pokémon de la misma especie (mismo número en la Pokédex).
"Item Clause": no se pueden repetir objetos, ni equipar Rocío Bondad en ningún Pokémon.
Entre los legendarios que se pueden usar (máximo dos) se encuentran Mewtwo, Lugia, Ho-Oh, Groudon, Kyogre, Rayquaza, Dialga, Palkia, Giratina, Reshiram, Zekrom, Kyurem, Xerneas, Yveltal y Zygarde.
Sin embargo, hay que destacar que los Pokémon míticos siguen estando completamente prohibidos, por lo que Mew, Celebi, Jirachi, Deoxys, Phione, Manaphy, Darkrai, Shaymin, Arceus, Victini, Keldeo, Meloetta, Genesect, Diancie y Hoopa seguirán sin poder usarse.
Respecto al resto de Pokémon legendarios (como Landurus y Cresselia) estos podrán seguirse usando sin ninguna restricción.
NOTA IMPORTANTE: Las Batallas DOBLES VGC, tendrán 1 único combate.